Все три варианта отличаются друг от друга аминокислотными последовательностями, изменения в которых возникли за счет мутаций в геноме. Тип А наиболее близок к коронавирусу, который циркулирует в популяции летучих мышей и является предковым по отношению к SARS-CoV-2. Иными словами, тип А, скорее всего, произошел непосредственно от дикого типа коронавируса. Тип А и тип С распространились за пределами Восточной Азии и встречаются в основном в Европе и США.
Тип В, являющийся производным от типа А (произошли две ключевые мутации), характерен для Азии, и он не получил большого распространения за ее пределами, за исключением мутировавших разновидностей. Это объясняется либо тем, что к этому типу существует иммунологическая устойчивость у остальной части населения Земли, либо экологическими барьерами, либо эффектом основателя, когда при распространении на новые территории генетическое разнообразие смещается.
Во время распространения SARS-CoV-2 в китайском Ухане коронавирус типа B был ошибочно принят за исходный вирус. Затем тип В мутировал в тип С.
